Suivi de la diversité bactérienne sur les vasières intertidales

Date(s) (Création)
Point de contact(s): Dupuy Christine
Affiliation(s) 1 : UMR LIENSS 7276
Crédit Producteurs de données : UMR LIENSS 7276
Identifiant FR-DCSMM-PDS-VASIREMI
Résumé Les vasières intertidales sont un système clé du réseau étroitement connecté d’écosystèmes qui forment la transition entre le bassin versant et le domaine océanique. Leur forte productivité est liée à l’activité d’un biofilm de diatomées, dont le fonctionnement et le devenir ont récemment fait l’objet de plusieurs programmes de recherche. En revanche, le déterminisme et le devenir de la production bactérienne associée à la sécrétion d’ExoPolySaccharides dans ce biofilm est peu connu.
Les premières études montrent pourtant que cette production est au moins équivalent à celle des diatomées. Une vision intégrée du fonctionnement écologique des vasières intertidales dans un schéma plus global des flux de carbone demande donc impérativement de décrire et quantifier le déterminisme de cette production bactérienne et son devenir dans l’écosystème.
Mots-clés Diversité, Abondance, Bactéries, Vasières, Intertidal, Habitats et biotopes, Golfe de Gascogne, Pas d'espace particulier concerné, D4: Réseaux trophiques, D1: Biodiversité, Observation par point
Information Maître d'ouvrage :
UMR LIENSS 7276 2007-2013

Maîtres d'œuvre :
UMR LIENSS 7276 2007-2013

Financeur(s) :
ANR 2007-2011
CPER 2011-2013
Généalogie Dans le sédiment :
- Diversité bactérienne obtenue par pyroséquençage (sous-traité).
- Abondance totale des procaryotes mesurée par cytométrie en flux (méthode en cours de développement).
- Quantification de la capacité dénitrifiante bactérienne obtenue par PCR quantitative des gènes codant les enzymes impliqués dans la fonction dénitrifiante.
- Production bactérienne mesurée par marquage radioactif.

Sur des vasières, la variabilité temporelle de la diversité/abondance des procaryotes étant
Utilisation Accès confidentiel