Données obtenues lors d'analyses par Multiplex PCR suite à des épisodes de mortalité signalés sur les sites d'élevage de L. stylirostris dans le cadre du REC.
Une première version de la donnée créée le 20/01/2012 était disponible dans Sextant, avec l'ensemble des souches isolées, dates de prélèvements,etc.
Pour faciliter la lecture, ces informations ont été synthétisées dans cette nouvelle donnée, avec une colonne par année et la codification suivante :
D : détecté
ND : non détecté
NR : non recherché
Les histogrammes sont à lire de bas en haut pour les années 2007 à 2015.
Concernant la méthode d'analyse, il est important de préciser que pour l'espèce V.nigripulchritudo, la méthode utilisée permet de distinguer de façon spécifique les souches type "syndrome d'été" présentant un pathotype moyennement pathogène (MP) et celles de pathotype hautement pathogène (HP).
Par contre, cette technique ne permet pas de différencier les souches non pathogènes et les souches pathogènes "hors syndrome d'été", définies ici comme Non Typées (NT).
Enfin, les cultures bactériennes, réalisées par le CTA dans le cadre du REC, ne sont pas systématiquement analysées en multiplex PCR.