Données de RNAseq pour l'étude de l'effet de la température et de la nutrition sur la permissivité de l'huitre Crassostrea gigas a la maladie du POMS
Donnée RNAseq illumina SR 75pb projet DECICOMP, etude des effet de la temperature et de la nutrition sur la permissivité des huitres au POMS.
Simple
- Title
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Données de RNAseq pour l'étude de l'effet de la température et de la nutrition sur la permissivité de l'huitre Crassostrea gigas a la maladie du POMS
- Date (Creation)
- 2021-03-02
- Date (Publication)
- 2021-03-02
- Citation identifier
- FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_SEQ_TEMP_NUT_CRASSOSTREA_POMS
- Abstract
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Donnée RNAseq illumina SR 75pb projet DECICOMP, etude des effet de la temperature et de la nutrition sur la permissivité des huitres au POMS.
- Credit
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IFREMER, Interaction Hotes Pathogenes Environnement (IHPE)
- Point of contact
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Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER
sismer@ifremer
Publisher IFREMER, Interaction Hotes Pathogenes Environnement (IHPE)
Louis Boismorand
Author IFREMER, Interaction Hotes Pathogenes Environnement (IHPE)
Jeremie Vidal-Dupiol
Author IFREMER, Unité Ressources Marines en Polynésie (RMPF)
Guillaume Mitta
Author
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GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
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Habitats et biotopes
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Thèmes Sextant
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/Milieu biologique/Bio-Informatique
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ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
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Bioinformatique
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- Use limitation
- CC-BY (Creative Commons - Attribution)
- Access constraints
- License
- Use constraints
- License
- Language
- Français
- Character set
- UTF8
Vertical extent
- Reference system identifier
- EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
Spatial representation info
- Distribution format
-
Name Version
- OnLine resource
-
Protocol Linkage Name NETWORK:LINK
/home/ref-bioinfo/ifremer/ihpe/decicomp
- OnLine resource
-
Protocol Linkage Name WWW:LINK-1.0-http--metadata-URL
https://doi.org/10.12770/016b28f6-fe05-43da-b20f-c1151694bb65 Digital Object Identifier (DOI)
- Hierarchy level
- Dataset
- Statement
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Donnée de type fastq issue d'un séquençage illumina SR75bp. Effet temperature (13°C, 17°C, 23°C et 30°c) étudié sur la famille F11N et effet de la nutrition (nourris vs non nourris) sur F14R. Pool de 10 individus échantillonné en triplicat à T0, T3, T6, T12, T24 et T48.
Metadata
- File identifier
- 016b28f6-fe05-43da-b20f-c1151694bb65
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2023-07-06T12:27:05.469Z
- Metadata standard name
-
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
- Metadata standard version
-
1.0
- Metadata author
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Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER, Interaction Hotes Pathogenes Environnement (IHPE)
Vidal-Dupiol Jeremie
Local service desk
accessData
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![Overview](https://sextant.ifremer.fr/geonetwork/srv/api/records/016b28f6-fe05-43da-b20f-c1151694bb65/attachments/BioinfoMarine.png)