Diversité des virus entériques humains dans des huîtres contaminées avec une eau usée

L'objectif de l’expérience est de pouvoir caractériser des génomes viraux complets afin de pouvoir comparer les échantillons.

Title: Diversité des virus entériques humains dans des huîtres contaminées avec une eau usée

Citation identifier: FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_DIVERSITE_VIRUS_ENTERIQUES_HUITRE

Abstract: L'objectif de l’expérience est de pouvoir caractériser des génomes viraux complets afin de pouvoir comparer les échantillons.

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Statement: Une eau usée a été utilisée pour contaminer 3 bacs d’eau de mer dans lesquels trois lots d'huîtres (deux lots d'huitres creuses et un lot d’huitre plate) ont été immergés pendant 24 heures. L'extraction et la purification des particules virales à partir de l'eau usée et des huitres, ont été réalisé sous forme de triplicats. La synthèse des cDNA ont été faites en utilisant deux types d'hexamers (random, et LSEM), et pour deux librairies avec ceux publiés par Endoh. La construction des librairies a été réalisée avec un kit ciblant les ARNs viraux (Vircap-Vert, Roche).

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