Densité annuelle de l'espèce Lepidotrigla cavillone dans le Golfe du Lion (MEDITS, 1994-2019)
La densité (nombre individus/km²) a été calculée annuellement à partir des données de la campagne MEDITS entre 1994 et 2019. Les données ont été transformées par logarithme décimal log10 (x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été effectués pour interpoler les données de densité dans le Golfe du Lion. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.
Simple
- Title
-
Densité annuelle de l'espèce Lepidotrigla cavillone dans le Golfe du Lion (MEDITS, 1994-2019)
- Date (Creation)
- 2020-08-07
- Citation identifier
- DOI:10.12770/b56236c1-00cd-448a-be0e-757289e3b936
- Abstract
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La densité (nombre individus/km²) a été calculée annuellement à partir des données de la campagne MEDITS entre 1994 et 2019. Les données ont été transformées par logarithme décimal log10 (x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été effectués pour interpoler les données de densité dans le Golfe du Lion. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.
- Credit
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Ifremer - Eolien flottant A06
- Point of contact
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Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER
Vaz Sandrine
Local service desk IFREMER
Hattab Tarek
Local service desk IFREMER
De Rock Pauline
Author IFREMER
Vaz Sandrine
Author IFREMER
Hattab Tarek
Author Ifremer
Publisher
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Thèmes Sextant
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/Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique
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GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
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Répartition des espèces
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Sous-regions marines
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/Métropole/Méditerranée occidentale
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Eolien - Jeu de données
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Medits
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Eolien - Type
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Densité
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Eolien - Groupe
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Ichtyofaune
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SIH - Espèces scientifiques
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Lepidotrigla cavillone
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- Use limitation
- CC-BY-NC-SA (Creative Commons - Attribution, Pas d’utilisation commerciale, Partage dans les mêmes conditions)
- Access constraints
- Copyright
- Use constraints
- Copyright
- Spatial representation type
- Grid
- Distance
- 0.05 meter
- Language
- Français
- Character set
- UTF8
- Topic category
-
- Oceans
- Begin date
- 1994-01-01
- End date
- 2019-12-31
- Unique resource identifier
- EPSG:4326
- Number of dimensions
- 1
- Dimension name
- Vertical
- Dimension size
- 1640
- Cell geometry
- Area
- Transformation parameter availability
- Distribution format
-
Name Version
- OnLine resource
- Hierarchy level
- Dataset
Conformance result
- Title
-
RÈGLEMENT (UE) N o 1089/2010 DE LA COMMISSION du 23 novembre 2010 portant modalités d'application de la directive 2007/2/CE du Parlement européen et du Conseil en ce qui concerne l'interopérabilité des séries et des services de données géographiques
- Date (Publication)
- 2010-12-08
- Explanation
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See the referenced specification
- Statement
-
La campagne MEDITS est une campagne de chalutage de fond standardisée et coordonnée à l'échelle internationale ciblant les ressources démersales et benthiques en mer Méditerranée et qui se déroule tous les ans au printemps depuis 1994. Chaque année, 65 stations fixes sont échantillonnées en moyenne dans le Golfe du Lion. L’identification de chaque individu capturé dans les traits de chalut est réalisée au niveau spécifique puis les poids et le nombre d'individus par espèce sont déterminés. La taille, le sexe et la maturité sont récoltés quand cela est prévu en fonction du protocole défini pour chaque espèce.
Les espèces correctement échantillonnées et suffisamment abondantes, c'est à dire possédant une occurrence minimum supérieure ou égale à 20% entre 1994 et 2019, ont bénéficié d'une cartographie annuelle sur cette période.
Une préparation des données a été préalablement effectuée avant la création des cartes de distribution. Le calcul de la surface balayée par trait de chalut a été effectué afin de calculer la densité totale (nombre individus/km²) par station, par année et par espèce. Les moyennes des latitudes et longitudes ont été calculées par trait de chalut. De façon à travailler dans un système orthonormé, la longitude a été transformée (Lon*cos(Lat*pi/180)).
La différenciation entre les juvéniles et les adultes pour chaque espèce n'a pas été réalisée à cause du manque du données de taille. Un travail bibliographique a été effectué pour identifier les adultes reproducteurs (servant de proxi des zones de frayères) des adultes non reproducteurs (en phase de croissance) pour les espèces de poissons.
La différenciation entre adultes reproducteurs et non reproducteurs chez les poissons est indiquée ci-dessous:
Espèce Fonction Sources taille et période de reproduction
Arnoglossus laterna Adulte reproducteur Ilkyaz et al., 2017
Callionymus maculatus Adulte reproducteur Burgeot et al, 1993
Capros aper Adulte reproducteur Yapici & Filiz, 2014
Cepola macrophthalma Adulte reproducteur Stergiou, 1999
Conger conger Adulte reproducteur Vallisneri et al., 2007
Lepidotrigla cavillone Adulte reproducteur Campillo, 1992
Serranus hepatus Adulte reproducteur voir "Source 1"
Concernant la distribution des espèces, les données ont d'abord été transformées par logarithme décimal log10(x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été réalisés par stade de vie pour créer les cartes de densité interpolée. Un variogramme empirique permet d'observer la relation spatiale des points d'échantillonnage : il va calculer l’autocorrélation entre chaque paire de points dans des classes de distances croissantes et identifier si les points ont une organisation particulière dans l’espace. Le variogramme, basé sur les données multi-annuelles (moyenne des densités par station), a été ajusté par une des fonctions continues autorisées dans le cadre de la géostatistique : effet pépitique, exponentiel, circulaire, sphérique, puissance ou gaussien, choisie sur la base du meilleur ajustement statistique. Les géostatistiques ne peuvent être en principe appliquées que si les données ont un comportement isotropique (varient de la même façon dans toutes les directions). De façon à vérifier cette condition, un variogramme directionnel dans quatre directions (0°, 45°, 90°, 135°) a également été produit pour détecter une possible anisotropie des données, ce qui n’a pas été le cas. Enfin, de façon à vérifier qu’aucune tendance longue portée ne vienne perturber significativement l’estimation krigée, une cross-validation a été réalisée a posteriori pour vérifier l’utilité de sa prise en compte, ce qui a été rejeté dans tous les cas. Un krigeage utilisant les paramètres du variogramme ajusté précédemment et avec une résolution de 0.1° va estimer les valeurs de densité annuelles aux emplacements non échantillonnés ainsi que l’estimation de la variance (ou erreur) de krigeage permettant d’avoir une mesure de l’incertitude liée à l’estimation. L’erreur de krigeage correspond ici à l’écart-type (racine carré) de la variance de krigeage. Une rastérisation avec une résolution de 0.05° et une distance maximum d’extrapolation de 0.2° est ensuite effectuée pour obtenir les cartes de densité interpolée annuelles par espèce. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.
- Description
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Occurrence minimum supérieure ou égale à 20%
- Rationale
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Sélection des espèces suffisamment échantillonnées pour une cartographie annnuelle
- Description
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Recherche bibliographique sur la période de reproduction des poissons
- Rationale
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Identification des adultes reproducteurs et des adultes non reproducteurs
- Description
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Surface = distance (km) / ouverture filet (km)
- Rationale
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Calcul de la surface balayée par trait de chalut
- Description
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Densité totale = nombre individus / surface (km²)
- Rationale
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Calcul de la densité totale par espèce, par trait de chalut, par date
- Description
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Log10(x+1)
- Rationale
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Normalisation des données
- Description
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Construction et modélisation d'un variogramme
- Rationale
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Exploration des données - Autocorrélation spatiale entre chaque paire de points
- Description
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Krigeage ordinaire
- Rationale
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Interpolation des données annuelles réelles dans la zone d'étude
- Description
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Rastérisation
- Rationale
-
Deuxième interpolation avec une résoluation à 0.05
Metadata
- File identifier
- b56236c1-00cd-448a-be0e-757289e3b936
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2021-12-20T15:44:50
- Metadata standard name
-
ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT
- Metadata standard version
-
1.0
- Metadata author
-
Organisation name Individual name Electronic mail address Role IFREMER
De Rock Pauline
Author IFREMER
Vaz Sandrine
Local service desk IFREMER
Hattab Tarek
Local service desk