Title

Données brutes de métabolomique c gigas projet Mollusc 2019

Date (Publication)

2019-06-14

Citation identifier

FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_METABOLOMIQUE_CRASSOSTREA_GIGAS

Abstract

Approche globale; Données brutes des analyses métabolomiques obtenues par le Laberca en 2019 ; NSI juvéniles C gigas échantillonnées sur le terrain haut/milieu/bas à deux temps en 2018; projet MOLLUSC fondation ARC 2018 2019; deux méthodes de métabolomiques et deux modes (positif et négatif): HILIC+ HILIC- RP+ RP-. données brutes issues des instruments. recherche des métabolismes corrélés à l'adaptation de C gigas à son environnement extrême intertidal. Une étude par approche métabolomique non-ciblée a été envisagée par spectrométrie de masse haute-résolution (HRMS) sur deux groupes d’huîtres. Un groupe d’huîtres saines (condition physiologique) et un autre d’huîtres infectées par le virus (condition pathologique), ont été soumis à trois conditions de température selon le mode de vie sur estran, haut, milieu et bas.

Credit

laberca, Projet Mollusc de la fondation ARC

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IFREMER	Corporeau Charlotte	Charlotte.Corporeau@ifremer.fr	Author

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Habitats et biotopes

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

• Bioinformatique

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CC-BY-NC-SA (Creative Commons - Attribution, Pas d’utilisation commerciale, Partage dans les mêmes conditions)

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Restricted

Language

Français

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UTF8

Topic category

• Environment

Begin date

2018-02-05

End date

2018-02-23

Reference system identifier

EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6

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OnLine resource

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NETWORK:LINK	/home/ref-bioinfo/ifremer/pfom/mollusc
WWW:LINK	https://doi.org/10.17600/18000004	Campagne Bicose 2

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Statement

Le laboratoire a effectué la préparation de l’ensemble des échantillons après avoir réalisé plusieurs prétests pour une meilleure extraction des métabolites, et a analysé les variations du métabolome en appliquant deux approches complémentaires : la chromatographie en phase inverse (RP) et la chromatographie d’interaction hydrophile (HILIC) en couplage avec la spectrométrie de masse à haute résolution de type Orbitrap. Le Laberca était également en charge de la comparaison statistique de ces données.

Metadata

File identifier

c8702ece-47b4-447a-8466-7a846a67a791

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Français

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Dataset

Date stamp

2024-05-21T08:57:58.216Z

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ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

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1.0

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