Title

Séquençage de génome de souches bactériennes : Salmonella, E.coli, Vibrio spp

Date (Creation)

2018-01-01

Citation identifier

FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_DIVTISO_2017

Abstract

Ces génomes proviennent principalement de souches bactériennes (Vibrio, E.coli, Salmonelles ...) de l'environnement et d'autres sources (clinique et référence).

Credit

Ifremer - Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie

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IFREMER	Gourmelon Michele	Michele.Gourmelon@ifremer.fr	Author
IFREMER	Hervio Heath Dominique	Dominique.Hervio.Heath@ifremer.fr	Author
IFREMER	Lozach Solen	Solen.Lozach@ifremer.fr	Author

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• Habitats et biotopes

Thèmes Sextant

• /Milieu biologique/Bio-Informatique

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

• Bioinformatique

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Français

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• Environment

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EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6

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OnLine resource

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Statement

Moyen d’acquisition : Plateforme de séquençage GATC / Eurofins Genomics, Séquenceur Illumina HiSeq 4000 type paired-end 450 bases.

Données acquises dans le cadre des différents projets du LSEM (RiskManche, virulence de Vibrio...).

Les données sont les séquences brutes, en sortie du séquenceur.

Metadata

File identifier

f1a1ee3d-8bd8-4472-b58b-f31d05259c17

Metadata language

Français

Character set

UTF8

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Dataset

Date stamp

2023-07-06T13:09:17.481Z

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ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

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