Diversité des virus entériques humains dans des huîtres contaminées avec une eau usée

L'objectif de l’expérience est de pouvoir caractériser des génomes viraux complets afin de pouvoir comparer les échantillons.

Data accessChemin d'accès	/home/ref-bioinfo/ifremer/sg2m/bioacc-3h
Date(s)Date(s)	02-01-2019 (Creation)
Author(s)Auteur(s)	Schaeffer Julien (IFREMER)
SourceSource	Ifremer - Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie
LineageGénéalogie	Une eau usée a été utilisée pour contaminer 3 bacs d’eau de mer dans lesquels trois lots d'huîtres (deux lots d'huitres creuses et un lot d’huitre plate) ont été immergés pendant 24 heures. L'extraction et la purification des particules virales à partir de l'eau usée et des huitres, ont été réalisé sous forme de triplicats. La synthèse des cDNA ont été faites en utilisant deux types d'hexamers (random, et LSEM), et pour deux librairies avec ceux publiés par Endoh. La construction des librairies a été réalisée avec un kit ciblant les ARNs viraux (Vircap-Vert, Roche).
ConstraintsContraintes	Use limitation Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/ Access constraints Restricted Use constraints Restricted
Spatial informationsInformations géographiques	Coordinate systemSystème de coordonnées WGS 84 (EPSG:4326)

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