RNA-Seq juvéniles de bar: Projet 3S (Seabass, Sex and Stress)

Date(s) (Création)
Auteur(s):
Affiliation(s) 1 : IFREMER
Éditeur(s): IFREMER
Crédit CNRS MGX
Identifiant FR-330-715-368-00032-IFR_CNRS_RNA_SEQ_JUV_BAR
Résumé Données de séquençage de 122 échantillons (P2: 10, P3: 69 et P4 (gonades): 43). Séquencées par un HiSeq 2500 d'Illumina
Mots-clés Habitats et biotopes
Généalogie 1 Procédures expérimentales

1.1 Préparation d'une banque de mRNA

La préparation de la banque se fait à l'aide d'un kit TruSeq Stranded mRNA Sample Preparation kit d'Illumina. Elle comprend 7 étapes :

1. La sélection des ARN polyadenylés sur billes magnétiques oligo(dT) ;

2. La fragmentation chimique des ARN sélectionnés ;

3. La synthèse du premier brin de cDNA (random primers + SuperScript II) en présence d'actinomycine D afin de bloquer la synthèse du second brin ;

4. La synthèse du second
Utilisation Diffusion générale restreinte.
Etendue temporelle 2018-09-03 - 2019-09-02