Données brutes de métabolomique c gigas projet Mollusc 2019
Approche globale; Données brutes des analyses métabolomiques obtenues par le Laberca en 2019 ; NSI juvéniles C gigas échantillonnées sur le terrain haut/milieu/bas à deux temps en 2018; projet MOLLUSC fondation ARC 2018 2019; deux méthodes de métabolomiques et deux modes (positif et négatif): HILIC+ HILIC- RP+ RP-. données brutes issues des instruments. recherche des métabolismes corrélés à l'adaptation de C gigas à son environnement extrême intertidal. Une étude par approche métabolomique non-ciblée a été envisagée par spectrométrie de masse haute-résolution (HRMS) sur deux groupes d’huîtres. Un groupe d’huîtres saines (condition physiologique) et un autre d’huîtres infectées par le virus (condition pathologique), ont été soumis à trois conditions de température selon le mode de vie sur estran, haut, milieu et bas.
| Data accessChemin d'accès | /home/ref-bioinfo/ifremer/pfom/mollusc |
| Date(s)Date(s) |
|
| Author(s)Auteur(s) | Corporeau Charlotte
(IFREMER)
|
| Contact(s)Contact(s) | IFREMER
|
| SourceSource |
laberca, Projet Mollusc de la fondation ARC |
| LineageGénéalogie |
Le laboratoire a effectué la préparation de l’ensemble des échantillons après avoir réalisé plusieurs prétests pour une meilleure extraction des métabolites, et a analysé les variations du métabolome en appliquant deux approches complémentaires : la chromatographie en phase inverse (RP) et la chromatographie d’interaction hydrophile (HILIC) en couplage avec la spectrométrie de masse à haute résolution de type Orbitrap. Le Laberca était également en charge de la comparaison statistique de ces données. |
| ConstraintsContraintes |
|
| Spatial informationsInformations géographiques |
|
)))