Metabarcoding 16S de fientes d'oiseaux de bord de mer et d'élevage, de phoques, d'eaux de STEP et de déchets fécaux de bovins et porcins

Date(s) (Création)
Auteur(s): ,
Affiliation(s) 1 : IFREMER
Crédit Ifremer - Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie
Identifiant FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_BAC_TRAC2
Résumé Ce jeu de données permet d'avoir une vue d'ensemble sur la diversité des communautés bactériennes présentes dans les fèces et les effluents de différentes origines. Le but est de développer de nouveaux marqueurs moléculaires associés à ces différentes origines/hôtes pour identifier l'origine des contaminations fécales dans l'environnement.
Mots-clés Habitats et biotopes
Généalogie Les nouvelles technologies de séquençage haut débit (NGS) proposent de nouvelles méthodes d'analyse de la diversité microbienne dont la métagénomique. Cet outil a été sélectionné dans le cadre du projet BacTrac ((BACtéries fécales, TRACeurs de contamination dans les eaux, 2016-2019) pour développer de nouvelles boites à outils de "Microbial Source Tracking" (MST, pour traceurs de sources microbiennes). Un échantillonnage de fèces et d'effluents de différentes origines (sources de pollutions) a
Utilisation Accès restreint

Diffusion générale restreinte.

Diffusion générale restreinte.