Séquençage de génome de souches bactériennes : Salmonella, E.coli, Vibrio spp

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Ces génomes proviennent principalement de souches bactériennes (Vibrio, E.coli, Salmonelles ...) de l'environnement et d'autres sources (clinique et référence).

Data accessChemin d'accès	/home/ref-bioinfo/ifremer/sg2m/wgs-lsem-brest
Date(s)Date(s)	01-01-2018 (Creation)
Author(s)Auteur(s)	Gourmelon Michele (IFREMER) Hervio Heath Dominique (IFREMER) Lozach Solen (IFREMER)
SourceSource	Ifremer - Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie
LineageGénéalogie	Moyen d’acquisition : Plateforme de séquençage GATC / Eurofins Genomics, Séquenceur Illumina HiSeq 4000 type paired-end 450 bases. Données acquises dans le cadre des différents projets du LSEM (RiskManche, virulence de Vibrio...). Les données sont les séquences brutes, en sortie du séquenceur.
ConstraintsContraintes	Use limitation Donnée en accès restreint Access constraints Restricted Use constraints Restricted
Spatial informationsInformations géographiques	Coordinate systemSystème de coordonnées WGS 84 (EPSG:4326)

Data accessAccès aux données

accessData

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