Séquençage de génome de souches bactériennes : Salmonella, E.coli, Vibrio spp
Ces génomes proviennent principalement de souches bactériennes (Vibrio, E.coli, Salmonelles ...) de l'environnement et d'autres sources (clinique et référence).
Data access Chemin d'accès |
/home/ref-bioinfo/ifremer/sg2m/wgs-lsem-brest
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Date(s) Date(s) |
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Author(s) Auteur(s) |
Gourmelon Michele
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IFREMER
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Hervio Heath Dominique ( IFREMER ) Lozach Solen ( IFREMER ) |
Source Source |
Ifremer - Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie |
Lineage Généalogie |
Moyen d’acquisition : Plateforme de séquençage GATC / Eurofins Genomics, Séquenceur Illumina HiSeq 4000 type paired-end 450 bases. Données acquises dans le cadre des différents projets du LSEM (RiskManche, virulence de Vibrio...). Les données sont les séquences brutes, en sortie du séquenceur. |
Constraints Contraintes |
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Spatial informations Informations géographiques |
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